Buenas tardes,
Efectivamente, la elección de la solución debe depender de vuestras necesidades.
Por ejemplo, en PHP, gratuito, aconsejo
http://www.mantis.org.
Si lo que necesitas es una solución que en un futuro abarque otras necesidades (Gestión Documental, integración con Portal, Gestión de Contenidos, gestión de tramitaciones, etc.) y todo con una única base de datos centralizada (y ya estamos hablando de ir construyendo, perfilando y apuntando a ECM) precisas de una solución mucho más flexible, y, sobre todo, basada en un único repositorio de información abierto para integrarse con otras aplicaciones.
Por ejemplo,
http://www.content-sort.com.
Conclusión: debes tener dos cosas muy claras:
- Tus necesidades funcionales (sin olvidar el futuro)
- Estrategia tecnológica (Windows/Linux, PHP/.NET/Java, informática interna o externalizada, integración de la información, etc.)
Y entonces, decide por un producto.
Un saludo,
Ignacio Parres